缺磷時，葉小而窄，密生，失去光澤呈現暗綠色；越冬老葉淡綠色至暗綠色或古銅色，無光澤，間或有褐色不定形枯斑，嚴重的變褐枯死；開花時老葉突然大量脫落，落葉多是葉尖先發黃，先端或者邊緣有焦斑。嚴重缺磷時樹體生長衰弱，下部老葉葉柄呈現紫紅色，形成“小老樹”。缺磷主要發生在花芽和果實形成期，花蕾少，座果率低，落果多，果實小而遲熟，畸形，果面粗糙，果皮變厚；果實后期空心、中心柱開裂，囊瓣分離，果汁少、味酸，品質低劣。
(1)磷容易被土壤固定，建議對缺磷土壤進行穴施肥，可在3~10月份挖穴深施過磷酸鈣、鈣鎂磷、磷礦粉等磷肥，施磷肥須將磷肥施至柑橘根系密布處為佳，最好與有機肥混合堆漚后深施。
(2)果樹表現缺磷時，可選用水溶性磷肥，如過磷酸鈣和重過磷酸鈣0.8-1公斤/棵或水溶性復合肥1-1.5公斤/棵進行灌施。
(3)根外施肥可用0.3%~0.6%磷酸二氫鉀，或者0.5%~1.0%過磷酸鈣葉面噴施，7~10天1次，連噴2~3次；但是在高溫高濕地區，8月過后不宜在噴施磷肥，以防藻類大量產生。干旱高溫季節，進行地面覆蓋，保持土壤水分，促進根系吸收磷。
土壤中磷含量低，特別是過酸性紅壤和紅黃壤，磷易被活性鐵等固定；而土壤鈣含量高或者施用石灰過多造成土壤堿性增強，磷又易被鈣固定位磷酸鈣，都會造成土壤的有效磷含量降低。土壤干旱、生物活動性差等因素也可誘導土壤缺磷。氮肥施用過多或者鎂肥不足，會影響柑橘根系多磷的吸收利用。
