從苗期到穗期均可發生，引起苗腐、莖基腐、稈腐和穗腐，以穗腐為害最大。濕度大時，病部均可見粉紅色霉層。苗腐:由種子帶菌或土壤中的病菌侵染所致。先是芽變褐，然后根冠腐爛。輕者病苗黃瘦，重者幼苗死亡。手拔病株易自腐爛處拉斷，斷口褐色，帶有粘性的腐爛組織。莖基腐:幼苗出土至成熟均可發生，麥株基部組織受害后變褐腐爛，致全株枯死。稈腐:初在葉鞘上出現水漬狀褪綠斑，后擴展為淡褐色至紅褐色不規則形斑。病情嚴重時，造成病部以上枯黃，有時不能抽穗或抽出枯黃穗。穗腐:發生初期，在小穗和穎片上出現小的水漬狀淡褐色病斑，后逐漸擴大至整個小穗，小穗枯黃。濕度大時，病斑處產生紅色膠狀霉層。后期病斑上密生小黑點，即子囊殼。后擴展至穗軸，病部枯褐，使被害部以上小穗，形成枯白穗

(1)栽培防治是赤霉病防治的基礎。①深耕滅茬。深耕滅茬是減少菌源的重要途徑:②追肥不能過晚，追肥過晚容易造成貪青晚熟，延長病菌侵染的時間和增加侵染機會，另外，可造成無效分蘗多，加重流行。

(2)選用抗耐避病品種是重要的防治措施。盡管沒有抗病品種，但品種間還是存在很大差異的，特別要選擇抗擴展的品種。除了抗性外，選擇品種還要考慮如下原則:①適當株高:②抽穗一致:③穗層整齊;④花藥殘留時間短;⑤灌漿速度快。

(3)由于氣候條件不同，麥株抽穗揚花時期和快慢亦有不同，故施藥日期、次數較難掌握，建議在小麥齊穗后揚花前噴施內吸長效性殺菌劑。藥劑用32.5％苯甲·嘧菌酯2000倍液，或300克升苯甲·丙環唑乳油1500倍液，或畝用47％三唑酮·多可濕性粉劑120g，或25％氯烯菌酯懸浮劑1500倍液噴霧，畝用水量30kg。

小麥赤霉病的流行與氣象因素密切相關，病菌發育最適宜的溫度為24-28℃，最低8℃，最高32℃。相對濕度80％～100％時發育最好，子囊殼和子囊孢子形成的最適溫度為20-25℃，分生孢子產生速度最快的氣溫為25℃。一般來說，小麥抽穗后的溫度條件都是滿足病原菌發育生長的，流行的關鍵是陰雨天氣，小麥赤霉病流行的品種因素也很重要。目前，赤霉病的抗病育種工作取得了一些進展，但是還沒有真正獲得理想的抗病品種，品種對赤霉病的抗性類型有抗侵染和抗擴展兩類抗性。除了抗性外，小麥的體態形態與赤霉病流行也有關系:①植株高矮。矮稈品種接受土表彈射到穗層的子囊孢子比適當株高的品種要多得多。②抽穗整齊與否，齊穗時間長短。如果抽穗整齊，齊穗時間短，遇到降雨的機會就少，可以減輕流行。③揚花期時間長短。揚花期對病原菌的入侵起到一種協助作用，殘存的揚花期能給病原菌提供像培養基那樣的營養，從而幫助病菌侵入。④灌漿速度快慢與否。灌漿速度快，則降低病菌的擴展范圍。小麥赤霉病流行與栽培管理和種植方式也有密切關系，地勢低洼，土質黏重，排水不良，造成麥田濕度高，降低小麥根系呼吸和抗病能力。玉米小麥輪作地，翻耕不深，玉米稈大量還田和帶菌殘渣為小麥生長后期赤霉病流行提供大量菌源。